Tecnología puede ayudar con la detección de bacterias resistentes a los antibióticos

A medida que las bacterias comunes como el estreptococo y la salmonela se vuelven resistentes a los medicamentos, lo que solían ser infecciones fácilmente tratables ahora pueden plantear desafíos médicos difíciles para los veterinarios.

Una nueva investigación de la Universidad de Georgia muestra que puede haber más salmonella resistente a los antimicrobianos de lo que los científicos pensaban anteriormente en los animales de consumo. (Lea: Bacterias, resistencia en abundancia)

Utilizando la tecnología que desarrolló, la investigadora de la UGA Nikki Shariat y Amy Siceloff, estudiante de doctorado de primer año en el Departamento de Microbiología, descubrieron que los métodos de cultivo tradicionales utilizados para analizar el ganado en busca de bacterias problemáticas a menudo pasan por alto las cepas de salmonela resistentes a los medicamentos. Este hallazgo tiene implicaciones para el tratamiento de los animales de consumo enfermos y las personas que se infectan al comer carne contaminada.

El estudio, publicado en Antimicrobial Agents and Chemotherapy, mostró que el 60 % de las muestras fecales de ganado contenían múltiples cepas de salmonela que los métodos de prueba tradicionales no detectaban. Lo que es más alarmante, Shariat descubrió que aproximadamente una de cada 10 muestras dieron positivo para una cepa de salmonela resistente a los medicamentos llamada Salmonella Reading. Además de ser resistente a los antibióticos, la lectura de Salmonella puede causar enfermedades graves en las personas.

Surge una nueva tecnología

Desarrollado por Shariat en 2015, CRISPR-SeroSeq permite a los investigadores analizar todos los tipos de salmonela presentes en una muestra determinada. Los métodos tradicionales solo examinan una o dos colonias de bacterias, y posiblemente pierdan por completo algunas cepas de salmonela. La tecnología de Shariat identifica firmas moleculares en las regiones CRISPR de la salmonela, una parte especializada del ADN de la bacteria. También ayuda a los investigadores a identificar qué cepas de bacterias son más abundantes. (Lea: Parásitos del ganado: ¿hasta cuándo?)

En el estudio actual, Shariat y sus colegas encontraron múltiples cepas de salmonela en las heces del ganado antes de que los animales fueran tratados con el antibiótico tetraciclina. Después del tratamiento, se eliminaron varias de las cepas dominantes de salmonela de la muestra, lo que permitió que prosperara la lectura de Salmonella.

Los métodos de cultivo tradicionales omitieron la cepa resistente a los antibióticos en las muestras originales. Solo una vez que el antibiótico eliminó las cepas más abundantes, los métodos convencionales pudieron detectar la lectura de Salmonella en las muestras.

“Esto sugiere que las pruebas tradicionales han subestimado la cantidad de bacterias resistentes a los antibióticos en el pasado”, dijo Shariat, profesora asistente de salud de la población en la Facultad de Medicina Veterinaria. (Lea: El abuso de antibióticos en la producción animal y sus consecuencias en los humanos)

Pero CRISPR-SeroSeq es una herramienta mucho más sensible. Señaló la lectura de Salmonella antes del tratamiento con antibióticos.

“Necesitamos conocer los perfiles de resistencia a los antimicrobianos de las bacterias que están presentes en los animales”, dijo y agregó que “ese conocimiento podría hacernos cambiar nuestra elección del tipo de antibiótico que usamos para tratar a los animales enfermos. También puede ayudarnos a seleccionar el mejor antibiótico para las personas que se enferman por comer carne contaminada”.

Perdiendo la marca

La investigación de Shariat muestra que los esfuerzos de vigilancia actuales probablemente subestiman la cantidad de resistencia a los antimicrobianos que existe. (Lea: Conozca cómo actúan las bacterias promotoras del crecimiento del pasto)

Las agencias que rastrean la resistencia a los antimicrobianos, como la FDA, el USDA y los CDC, entre otras, aún dependen de los métodos de muestreo tradicionales, lo que significa que pueden no tener reservorios de bacterias resistentes a los medicamentos.

“El problema es que tiene cientos de colonias de salmonela en una muestra determinada, pero solo elige una o dos de ellas para analizar”, expluso y agregó que se convierte en un juego de números en el que los investigadores solo seleccionan los más abundantes, “esto significa que subestiman los diferentes tipos de salmonela que están presentes”.

El uso de CRISPR-SeroSeq puede ayudar a llenar ese vacío de conocimiento, dando a los investigadores una mejor idea de cuántas bacterias resistentes a los antibióticos existen. Esta información puede ayudar a los ganaderos a reducir y controlar los brotes y orientar las políticas sobre cómo luchar contra una creciente amenaza para la salud pública.

Fuente: Mundo Agropecuario.